MSA
Alinhamento Múltiplo de Sequências
O MSA é um processo que alinha sequências biológicas (como DNA, RNA ou proteínas) de forma a identificar regiões de similaridade entre elas, sendo que estas regiões podem indicar:
- Funções biológicas semelhantes;
- Origem evolutiva comum;
- Áreas conservadas importantes para a estrutura ou função da molécula.
(*)- Indica uma coluna totalmente conservada.
(:)- Indica as colunas em que todos os resíduos têm aproximadamente o mesmo tamanho e a mesma hidropatia.
(.)- Indica as colunas em que o tamanho ou a hidropatia foram preservados ao longo da evolução.
De forma geral, os aminoácidos está totalmente conservada.
O alinhamento múltiplo de sequências (MSA) da proteína FTO entre várias espécies de primatas revela regiões altamente conservadas, indicadas por asteriscos (*). Estas regiões, comuns a todas as sequências, correspondem a domínios funcionais essenciais, nomeadamente o domínio AlkB, responsável pela atividade desmetilase da proteína.
A sequência "PLHQDGCFYMLDDLNATHQCVLAGS" é completamente conservada em todas as espécies, o que revela o seu papel estrutural/catalítico.
As regiões variáveis, assinaladas com : ou ., são menos frequentes e encontram-se sobretudo nas extremidades da proteína, podendo estar associadas a adaptações específicas ou flexibilidade estrutural.
Ferramenta utilizada:
Sequence logo
