Domínios e Elementos Regulatórios
A análise no Pfam e InterPro revelou dois domínios funcionais na proteína FTO pertencentes à família AlkB-like: o domínio catalítico e o domínio C-terminal .
O primeiro é essencial para a função enzimática da FTO.
Enquanto que o domínio C-terminal, com estrutura em hélice alfa, está fortemente associado ao aumento do IMC e ao risco de obesidade nos humanos.
Imagem retirada do InterPro
No Prosite, não identificamos motifs relevantes, excluindo motifs com baixa especificidade. Assim, a análise centrou-se nos domínios funcionais validados pelo InterPro e CDD.
Análise do contexto genómico do FTO (Genome Browser)
Análise das tracks ativas na imagem:
Layered H3K27Ac:
- Marca zonas de cromatina ativa, típicas de promotores e enhancers.
- Vários picos nesta região indicam atividade regulatória forte.
GeneHancer+ Interações (Double Elite):
- As linhas curvas mostram interações entre enhancers distais e genes como FTO e RPGRIP1L.
- Indica que a regulação do FTO pode envolver elementos distantes (regulação a longa distância).
ReMap density + ChIP-seq:
- Picos altos indicam locais de ligação de fatores de transcrição validados por ChIP-seq.
- Os picos coincidem com as zonas marcadas por GeneHancer → apoio à regulação prevista.